五月二十九日
信長は蒲生賢秀(がもうかたひで)を安土城留守衆(るすいしゅう)に決めて二の丸に入れ、この日の早朝、安土を発った。
京都へ向かう途中、信長は、瀬田の唐橋の東南の畔(ほとり)にある瀬田城(せたじょう)(滋賀県大津市瀬田)に寄り、城主･山岡景隆(やまおかかげたか)と歓談した。
吉田兼見(よしだかねみ)が山科まで迎えに出たが、迎え衆は帰るようにといわれ、自邸へ帰った。
日暮れ前には本能寺に着いた。

フロイスの『日本史』にいう。
「この件で特別な任務を帯びた者が、兵士とともに内部に入り、ちょうど手を洗い終え、手拭(てぬぐい)で身体をふいている信長を見つけたので、ただちにその背中に矢を放ったところ、信長はその矢を引き抜き、鎌(かま)のような形をした長鎗(ちょうそう)である長刀(なぎなた)という武器を手にして出て来た。そしてしばらく戦ったが、腕に銃弾を受けると、自らの部屋に入り、戸を閉じ、そこで切腹したと言われ、また他の者は、彼はただちに御殿(ごてん)に放火し、生きながら焼死したと言った」

秀吉は船坂峠を船で迂回して、この日の早暁に姫路に着いた。
備中高松から姫路まで、約百㎞を四十八時間で走破したのである。

秀吉は続々と姫路に到着してくる兵たちを休ませ、蔵奉行に姫路城内の蔵に貯えてあった金銀や銭や蔵米を調べさせ、それらをすべて、なにもかもすっからかんになるまで将兵の身分に応じて惜しみなく分けあたえた。
秀吉は、ありったけの金をバラ撒いたのだ。
この豪気さによって、士気はいやがうえでも高まった。
秀吉の、人心の掌握の絶妙なうまさである。

光秀は退却し、勝竜寺城(しょうりゅうじじょう)(京都府長岡京市)に入った。
この城は、かつて娘の玉(たま)(ガラシャ)と細川忠興(ほそかわただおき)が婚礼の式を挙げた明智一族にはかかわりの深い城である。光秀の脳裏にはその婚礼の日のことがよみがえったに違いない。
光秀に従う将兵は七百余であったという。勝竜寺城に向かう途中、逃げ散る兵も少なくなかった。
丹波亀岡(たんばかめおか)へ敗走する将兵を高山右近(たかやまうこん)と中川清秀(なかがわきよひで)が追撃(ついげき)し、翌十四日には亀岡城を取った。
『大かうさまくんきのうち』(太田牛一)によれば、光秀は、秀吉軍に包囲されていた勝竜寺城から深田(ふかだ)を這って出て、なんとか包囲網(ほういもう)を突破して淀川沿いに久我縄手(こがなわて)に逃れた。
斎藤利三(さいとうとしみつ)もなんとか逃亡できた。
光秀は坂本城を目ざした。坂本城に籠城するつもりだった。
勝竜寺城から久我縄手(こがなわて)を経由し、西ヶ岡、桂川を渡り、下鳥羽、大亀谷(だいかめだに)から桃山の北の鞍部(あんぶ)を東に越えて小栗栖(おぐるす)（京都市伏見区）まで逃げのびた。
が、ここで光秀は落ち武者狩りの土民(どみん)が竹藪のなかから斜め上に突きあげた槍に脇を刺された。